区别如下:
自贸区试行有条件的公司注册资本认缴登记制，除有规定的企业外，其余试行认缴制，不再登记实收资本，也不提交验资报告。
自贸区试行有条件的“先照后证”登记制。取得营业执照即可从事一般生产经营活动;申请从事其他许可经营项目的，应当在领取营业执照及许可证或者批准文件后，方可从事经营活动。
自贸区试行企业年度检验制度改为企业年度报告公示制度。
自贸区建立经营异常名录制度。
自贸区试行新的营业执照样式。
外商投资准入试行负面清单备案制。
外商投资广告企业试行备案制。
自贸区里注册公司和自贸区外的区别是什么
自贸区试行有条件的公司注册资本认缴登记制，除有规定的企业外，其余试行认缴制，不再登记实收资本，也不提交验资报告。
自贸区试行有条件的“先照后证”登记制。
取得营业执照即可从事一般生产经营活动;申请从事其他许可经营项目的，应当在领取营业执照及许可证或者批准文件后，方可从事经营活动。
自贸区试行企业年度检验制度改为企业年度报告公示制度。
自贸区建立经营异常名录制度。
将未按规定期限公示年度报告或者通过登记的住所(经营场所)无法取得联系等的企业载入经营异常名录，并通过市场主体信用信息公示系统向社会公示。
自贸区试行新的营业执照样式。
外商投资准入试行负面清单备案制。
对外商投资准入特别管理措施列表(负面清单)之外的领域，自贸区内外商投资企业向商务部门或其授权单位备案，并向登记机关申请设立登记。
外商投资广告企业试行备案制。
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